W ramach monitoringu siedliska Skaliste i kamieniste dno morskie, rafy (1170) badane są dwa komponenty środowiska biotycznego: makroglony oraz fauna poroślowa i fitofilna (Kruk-Dowgiałło i in. 2010).
Badaniami objęte są trzy stanowiska polskich obszarach morskich: głazowisko na Ławicy Słupskiej, głazowisko w rejonie miejscowości Rowy oraz próg podwodny u podnóża Klifu orłowskiego (rysunek).
W ramach monitoringu siedliska Duża płytka zatoka (1160) badane są trzy komponenty środowiska biotycznego: makrozoobentos, makrofity oraz ichtiofauna. W zakresie badań makrozoobentosu określa się skład taksonomiczny, liczebność i biomasę, zgodnie z przewodnikiem metodycznym (Kruk-Dowgiałło i in. 2010). Badania makrofitów obejmują: skład taksonomiczny i biomasę (Kruk-Dowgiałło i in. 2010). Badania ichtiologiczne wykonywane są włoczkiem dobrzeżnym w strefie brzegowej w obrębie siedliska. Ponadto, określony zostanie: (1) stopień antropogenizacji strefy brzegowej w granicach siedliska, (2) stopień porośnięcia szuwarem trzcinowym linii brzegowej w granicach siedliska oraz (3) stan piaszczystych łach występujących w obrębie siedliska.
Badaniami objęte jest Zatoka Pucka, jedyne w polskich obszarach morskich, stanowisko siedliska Duża płytka zatoka (1160) (rysunek).
W ramach monitoringu siedliska Zalewy i jeziora przymorskie, laguny (1150) badane są wszystkie parametry, zgodnie z przewodnikiem metodycznym (Zalewska-Gałosz 2010).
Badaniami objęte jest osiem stanowisk siedliska Zalewy i jeziora przymorskie, laguny (1150): Zalew Szczeciński, Zalew Kamieński, jezioro Resko Przymorskie, jezioro Jamno, jezioro Bukowo, jezioro Gardno, jezioro Łebsko i Zalew Wiślany (rysunek).
W ramach monitoringu siedliska Ujścia rzek, estuaria (1130) badane są: przekrój poprzeczny koryta rzeki w granicach siedliska zgodnie z przewodnikiem do ćwiczeń z hydrologii ogólnej (Bajkiewicz-Grabowska (2012), stan jakości wód, w tym: odczyn pH (metodą potencjometryczną), przezroczystość (zgodnie z normą PN-EN ISO 7072:2003), tlen rozpuszczony (metoda miareczkową, zgodnie z normą PN-EN 25813:1997), azot nieorganiczny (metoda obliczeniową w oparciu o oznaczenie: azotu amonowego (metoda spektrofotometryczna, wg procedury badawczej PB-06, Wyd. 2; z dn. 10.05.2007 r., metoda analogiczna do PN-ISO 7150-1: 2002 lub chromatografii jonowej wg normy PN-EN ISO 14911:2002), azotynowego (metoda spektrofotometryczna, wg procedury badawczej PB-05, Wyd. 2; z dn. 10.05.2007 r., metoda analogiczna do PN-EN 26777 lub chromatografii jonowej wg. normy PN-EN ISO 10304-1: 2009) i azotanowego (metoda spektrofotometryczna, wg procedury badawczej PB-04, Wyd. 2; z dn. 10.05.2007 r. lub chromatografii jonowej wg. normy PN-EN ISO 10304-1: 2009) oraz fosforany (metodą spektrofotometryczna, wg procedury badawczej PB-07 wydanie 2 z dnia 10.05.2007 r. lub chromatografii jonowej wg. normy PN-EN ISO 10304-1: 2009). Ponadto, rozpoznany będzie stan ujść badanych rzek pod katem charakteru i modyfikacja brzegów oraz zabudowy technicznej.
Badaniami objęte jest jedenaście stanowisk siedliska Ujścia rzek, estuaria (1130): Dziwna, Rega, Czerwona, Kanał Szczuczy, Piaśnica, Reda z Zagórską Strugą, Wisła Śmiała, Wisła Przekop, Szkarpawa, Nogat i Elbląg (rysunek)
W ramach monitoringu siedliska Piaszczyste ławice podmorskie (1110) badane są dwa komponenty środowiska: makrozoobentos i chemia osadów dennych. W zakresie badań makrozoobentosu określa się skład taksonomiczny, liczebność i biomasę, zgodnie z przewodnikiem metodycznym (Kruk-Dowgiałło i in. 2010). W zakresie badań chemicznych osadów dennych analizuje się całkowity węgiel organiczny, fosfor całkowity, azot całkowity oraz potencjał oksydoredukcyjny. Analizy laboratoryjne wykonywane są zgodnie z: (1) metodą spektrometrii w podczerwieni wg normy PN-ISO 10694:2002 lub PN-EN 13137:2004 – całkowity węgiel organiczny, (2) metodą atomowej spektrometrii emisyjnej ze wzbudzeniem w plazmie indukcyjnie sprzężonej (ICP-OES) po roztworzeniu rozdrobnionych próbek wodą królewską na gorąco (Procedura PB – 10 wydanie 5 z dnia 27.02.2014 r.) – fosfor całkowity, (3) metodą mineralizacji w środowisku kwaśnym z dodatkiem katalizatora, destylacja amoniaku i oznaczanie metodą miareczkową, wg normy PN-ISO 11261:2002 (zmodyfikowana metoda Kjeldahla) azot całkowity oraz (4) metodą potencjometryczną – potencjał oksydoredukcyjny.
Badaniami objęte są trzy stanowiska siedliska Piaszczyste ławice podmorskie (1110): Ławica Odrzana, ławica Słupska i Ławica Środkowa (rysunek)